Estudio de la variabilidad genética en accesiones de papa (Solanum tuberosum L.) mediante marcadores SSRs

Manuel Alejandro Sánchez

Abstract


En este trabajo se determinó la variabilidad genética de 30 accesiones de papa nativas (Solanum tuberosum L.) del banco de germoplasma que administra la Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (Corpoica), mediante cinco marcadores moleculares de tipo microsatélites (SSRs). En total, se identificaron 33 alelos con un rango entre 2 (STMS1049) hasta 10 (STMS1106), donde el contenido de información polimórfica (PIC) varió entre 0,368 (STM1049) hasta 0,574 (STM2022). El análisis de agrupamiento distribuyó las 30 accesiones de papas en siete grupos genéticos, con índices de similitud que oscilaron entre 0,452 (1231) hasta 0,841 (1439). A partir de los resultados obtenidos se puede concluir que con el uso de los marcadores moleculares empleados el material presentó variabilidad, poniendo en manifiesto el gran valor que tiene esta colección para los programas de mejoramiento genético de la especie.


Keywords


diversidad genética; germoplasma; marcadores moleculares; microsatélites; programas de mejoramiento genético

References


Ovchinnikova A., Krylova E., Gavrilenko T., Smekalova T., Zhuk M., Knapp S., Spooner D. Taxonomy of cultivated potatoes (Solanum section Petota: Solanaceae). Rev Bot J Linn. Soc. 2011; 165(2): 107-155. DOI: http://doi.org/10.1111/j.1095-8339.2010.01107.x.

Bonierbale M., Amoros W., Espinoza J., Mihovilovich E., Roca W., Gómez R. Recursos genéticos de la papa: don del pasado, legado para el futuro. Rev ALAP. 2004; 1: 3-13.

CIP, Centro Internacional de la Papa. 2016. Disponible en: http://cipotato.org/es.

FAOSTAT. Food and Agriculture Organization of the United Nations. 2014. Disponible en: http://faostat.fao.org/site/339/default.aspx.

Cucunubá LE. Diagnóstico del manejo ambiental del cultivo de la papa pastusa (solanum tuberosum), en un ecosistema de alta montaña, del municipio de Guatavita departamento de Cundinamarca. Tesis de Maestría, Facultad de Ciencias Contables Económicas y Administrativas, Universidad de Manizales, 2014.

AGRONET, Análisis-Estadísticas, Producción Nacional Por Producto. 2014. Disponible en: http://www.agronet.gov.co.

Machida-Hirano R. Diversity of potato genetic resources. Rev Breed Sci. 2015; 65(1): 26-40. DOI: http://doi.org/10.1270/jsbbs.65.26.

Valencia R., Lobo M., Ligarreto G. Estado del arte de los recursos genéticos vegetales en Colombia: Sistema de Bancos de Germoplasma. Rev Corpoica Cien Tecnol Agropecu. 2010; 11(1): 85-94. DOI: http://doi.org/10.21930/rcta.vol11_num1_art:198.

Osorio-Guarín JA. Caracterización molecular del banco de germoplasma de cacao (theobroma cacao, L.) del Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas (SINCHI) mediante marcadores moleculares tipo microsatélites. Tesis de Grado, Facultad de Ciencias, Pontificia Universidad Javeriana, 2009.

Tiwari J., Singh B., Gopal J., Poonam P., Patil V. Molecular characterization of the Indian Andigena potato core collection using microsatellite markers. Rev Afr J Biotechnol. 2013; 12:10. DOI: http://10.5897/AJB12.2436.

Muhinyuza JB., Shimelis H., Melis R., Sibiya J., Gahakwa D., Nzaramba MN. Assessment of genetic relationship of promising potato genotypes grown in Rwanda using SSR markers. Rev Aust J Crop Sci. 2015; 9(8): 696.

Ghebreslassie B., Githiri S., Mehari T., Kasili R., Ghislain M., Magembe E. Genetic diversity assessment of Farmers and Improved potato (Solanum tuberosum) Cultivars from Eritrea using Simple Sequence Repeat (SSR) markers. Rev Afr J Biotechnol. 2016; 15(35): 1883-1891. DOI: http://doi.org/10.5897/AJB2016.15237.

Doyle JJ., Doyle L. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Rev Phytochem Bull. 1987; 19: 11-15.

Ghislain M., Andrade D., Rodriguez F., Hijmans R., Spooner D. Genetic analysis of the cultivated potato Solanum Tuberosum L. Phureja Group using RAPDs and nuclear SSRs. Rev Theor Appl Genet. 2006; 113: 1515-1527. DOI: http://doi.org/10.1007/s00122-006-0399-7.

Nei M., Li W. Mathematical Model for Studying Genetic Variation In Terms Of Restriction Endonucleases. Rev PNAS. 1978; 76: 5269-5273. DOI: http://doi.org/10.1073/pnas.76.10.5269.

Peakall R., Smouse P. Genalex 6: Genetic Analysis in Excel. Population Genetic Software for Teaching and Research. Rev Mol Ecol. 2006; 6: 288-295. DOI: http://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x.

Hillis DM., Dixon MT. Ribosomal DNA: Molecular evolution and phylogenetic inference. Rev Q Rev Biol. 1991; 66: 411-453. DOI: http://doi.org/10.1086/417338.

Muñoz-Flórez JE., Morillo-Coronado AC., Morillo-Coronado Y. Microsatélites amplificados al azar (RAM) en estudios de diversidad genética vegetal. Rev Acta Agron. 2008; 57(4): 219-226.

San Juan A., Gálvez J., Plasencia M., Quirasco. Assessment of DNA extraction methods from various maize (Zea mays L.) tissues for environmental GMO monitoring in Mexico. Part I: Detectionbyend-point PCR. Rev Agrociencia. 2014; 48:17-33.

Hubert GY., Gupta PH., Patel NJ., Shah AK., Acharya RR., Talati JG. Molecular characterization of Indian potato (Solanum tuberosum L.) Varieties for cold-induced sweetening using SSR markers. Rev J Plant Sci. 2015; 3(4): 191-196. DOI: http://doi.org/ 10.11648/j.jps.20150304.14.

Liao H., Guo H. Using SSR to evaluate the genetic diversity of potato cultivars from Yunnan province (SWChina). Rev Acta Biol Craco Bota. 2014; 56: 16-27. DOI: http://doi.org/10.2478/abcsb-2014-0003.

Onamu R., Legaria J. Diversidad genética entre variedades de papa (Solanum tuberosum L.) cultivadas en México usando marcadores RAPD e ISSR. Rev Mex Cien Agr. 2014; 5(4), 561-575.

Tierno R., de Galarreta JIR. Characterization of high anthocyanin-producing tetraploid potato cultivars selected for breeding using morphological traits and microsatellite markers. Rev Plant Genet Resour. 2015; 1-10.

Pacheco E., Arias D., Ojeda Z., Romero H. Diversidad y estructura genética de accesiones de palma de aceite (Elaeis guineesis Jacq.) provenientes de Camerún. Rev Colomb Biotecnol. 2014; 16(2): 57-67. DOI: http://doi.org/10.15446/rev.colomb.biote.v16n2.40132.

Chambers GK., MacAvoy ES. Microsatellites: consensus and controversy. Comparative biochemistry and physiology Part B. Rev Biochem Mol Biol. 2000; 126(4): 455-476. DOI: http://doi.org/10.1016/S0305-0491(00)00233-9.

Cadima X., Gabriel J., Veramendi S. Uso de marcadores moleculares microsatélite para el análisis de la diversidad genética de papa nativa de Bolivia. Rev J Sel Andi Res Soci. 2013; 4:1- 4.

De Galarreta JR., Barandalla L., Lorenzo R., Gonzalez J., Rios DJ., Ritter E. Microsatellite variation in potato landraces from the island of La Palma. Revi Span J Agricu Res. 2013; 5(2), 186-192. DOI: http://doi.org/10.5424/sjar/2007052-5360.

Muthoni J., Shimelis H., Melis R. Study of genetic relationship among Kenyan cultivated potato clones using SSR markers. Rev Aust J Crop Sci. 2014; 8(4), 502.

Yujó D., Sarmiento F., Álvarez M., Brochero H., Gebhardt C., Mosquera T. Genetic diversity and population structure in diploid potatoes of group Phureja. Rev Crop Sci. 2015; 55(2): 760-769. DOI: http://doi.org/10.2135/cropsci2014.07.0524.

Navarro C., Bolaños C., Burbano T. Caracterización morfoagronómica y molecular de 19 genotipos de papa guata y chaucha (Solanum tuberosum L. y Solanum phureja Juz Et Buk) cultivados en el departamento de Nariño. Rev Cien Agr. 2010; 27(1): 27-39.

Sharma V., Nandineni MR. Assessment of genetic diversity among Indian potato (Solanum tuberosum L.) collection using microsatellite and retrotransposon based marker systems. Rev Mol Phylogenet Evol. 2014; 73:10-17. DOI: http://doi.org/10.1016/j.ympev.2014.01.003.

Esfahani ST., Shiran B., Balali G. AFLP markers for the assessment of genetic diversity in european and North American potato varieties cultivated in Iran. Rev Crop Breed Appli Biotechnol. 2009; 9: 75-86. DOI: http://doi.org/10.12702/1984-7033.v09n01a11.

Soto J., Medina T., Aquino Y., Estrada R. Diversidad genética de papas nativas (Solanum spp.) conservadas en cultivares nativos del Perú. Rev Per Biol. 2013; 20(3): 215-222.

González J., Peña G. Caracterización molecular de papas nativas (Solanum spp.) del distrito de Chungui, Ayacucho, mediante AFLP. Rev Per Biol. 2014; 21: 277-282.

Bernal-Parra N., Ocampo-Pérez J., Hernández-Fernández J. Caracterización y análisis de la variabilidad Genética de la granadilla (passiflora ligularis juss.) en Colombia empleando marcadores microsatélites. Rev Bras Frutic. 2014; 36, 598-611. DOI: http://doi.org/10.1590/0100-2945-251/13.

Oladosu Y., Rafii M., Abdullah N., Malek M., Rahim H., Hussin G., Kareem I. Genetic variability and diversity of mutant rice revealed by quantitative traits and molecular markers. Rev Agrociencia. 2015; 49(3): 249-266

Cruz E., Dantas AC., Carmo CD., Bastos LP. Molecular characterization of jaboticaba tree genotypes located in the municipalities of recôncavo of bahia. Rev Bras Frutic. 2016; 3: 38-39. DOI: http://doi.org/10.1590/0100-29452016510.




DOI: https://doi.org/10.19053/01228420.v14.n2.2017.7150

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