Caracterización molecular parcial de begomovirus aislados de arvenses colectadas en cultivos de tomate en el sureste del Valle del Cauca, Colombia

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Autores

Juan Carlos Vaca-Vaca https://orcid.org/0000-0002-8984-540X
Frenyiline Jara-Tejada https://orcid.org/0000-0003-2794-3845
Karina López-López https://orcid.org/0000-0003-3623-4725

Resumen

Las arvenses generalmente se consideran como una fuente de nuevos virus, pero a menudo se descuidan durante los estudios de diversidad. Previamente, se recolectaron once muestras de arvenses a lo largo de los bordes de un campo de cultivo de tomate ubicado en cuatro municipios (Florida, Ginebra, Cerrito y Candelaria) en el sureste del Valle del Cauca. Estas muestras fueron positivas para begomovirus, pero su caracterización molecular no se había realizado hasta ahora. Para cada muestra, se clonaron, secuenciaron y analizaron fragmentos de DNA. El análisis de la secuencia de nucleótidos de los fragmentos virales mostró la presencia de seis begomovirus diferentes: dos virus aislados de L. camara, Desmodium sp. y A. dubius fueron descritos previamente como el virus del mosaico amarillo de la papa (PYMV) y el virus de distorsión de la hoja de maracuyá (PLDV), respectivamente; otros cuatro virus que se aislaron de L. camara, A. dubius, R. humilis, Desmodium sp., R. minima, H. attenuatus, Verbena sp., C. hirtus y Caesalpinia sp., mostraron su mayor identidad de secuencia de nucleótidos (89%) con el virus del mosaico clorótico del frijol (BChMV), el virus de la distorsión de la hoja de la datura (DaLDV) y el virus del mosaico dorado de rhynchosia de Yucatán (RhGMYV). Los fragmentos de virus clonados de estas malezas podrían ser begomovirus nuevos que no se reportaron anteriormente, esto de acuerdo con el criterio de demarcación de especies de ICTV para el género Begomovirus (≥ 91% de identidad de secuencia). Este análisis también encontró la presencia de infecciones mixtas de begomovirus en las arvenses Desmodium sp. y A. dubius. Finalmente, este artículo reporta por primera vez tres arvenses hospederas alternativas de begomovirus que infectan cultivos de tomate y maracuyá: A. dubius para PYMV, y L. camara y Desmodium sp. para PLDV, respectivamente.

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