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Vol. 16 Núm. 2 (2022)

Sección de hortalizas

Caracterización molecular por SSR-HRM de germoplasma colombiano cultivado de Capsicum chinense Jacq. (Solanaceae)

https://doi.org/10.17584/rcch.2022v16i2.13363

Publicado 2022-05-01

  • José Enrique Lopéz-Candelo
    • ,
  • Ronald Andrés Viáfara-Vega
    • ,
  • Heiber Cárdenas-Henao

José Enrique Lopéz-Candelo
Universidad del Valle, Departamento de Biología, Grupo de Estudios Ecogenéticos y de Biología Molecular; Universidad del Valle, Centro de Investigación e Innovación en Bioinformática (CIBioFi), Santiago de Cali

Ronald Andrés Viáfara-Vega
Universidad del Valle, Departamento de Biología, Grupo de Estudios Ecogenéticos y de Biología Molecular; Universidad del Valle, Centro de Investigación e Innovación en Bioinformática (CIBioFi), Santiago de Cali

Heiber Cárdenas-Henao
Universidad del Valle, Departamento de Biología, Grupo de Estudios Ecogenéticos y de Biología Molecular; Universidad del Valle, Centro de Investigación e Innovación en Bioinformática (CIBioFi), Santiago de Cali

Habanero pepper fruits. Photo: L.L. Arias

Resumen

Este estudio es la primera aproximación al conocimiento de la diversidad genética de poblaciones cultivadas de chile habanero (Capsicum chinense) en Colombia utilizando SSR-HRM. Se caracterizaron tres líneas de chile habanero con ocho marcadores microsatélites utilizando la técnica High-Resolution Melting (HRM). Veintisiete individuos de la línea original HL y 30 de cada línea derivada HL-70 y HL67 fueron genotipificados. Tres microsatélites resultaron monomórficos y cinco polimórficos; sin embargo, se detectó una alta diversidad alélica en el estado homocigoto en los 87 individuos evaluados. El marcador Ng8 diferenció las líneas HL-original y HL-67 de la línea HL-70 a través de sus perfiles de HRM. El análisis de varianza molecular (AMOVA) reveló que el 52% de la variación genética existía dentro de las líneas. La línea HL-67 fue más similar a la línea HL-original que a la línea HL-70, HL-70 registró la mayor diversidad genética con respecto a las líneas derivadas y, por lo tanto, podría ser considerada en un nuevo programa de mejoramiento. En contraste, la línea HL-67, debido a su alta homogeneidad genética, podría potencialmente utilizarse para evaluar diferentes condiciones ambientales en busca de condiciones óptimas para aumentar su productividad y picor. Finalmente, la comparación de los perfiles de HRM obtenidos con los marcadores monomórficos (Ng 33, Ng 18 y Ng 10) nos permitió diferenciar entre las especies C. chinense y C. frutescens, esta diferenciación es difícil debido a la alta similitud morfológica entre estas dos especies y generalmente se evalúa en la etapa de floración, mientras que los perfiles de HRM se pueden realizar en cualquier etapa de la planta.

Palabras clave

Diversidad genética de cultivos, Identificación y discriminación de especies cultivadas, Utilidad de polimorfismos de nucleótido simple

PDF (English)

Citas

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