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Vol. 11 Núm. 2 (2017)

Sección de otras especies

Diversidad genética de <i>Moniliophthora roreri</i> mediante Polimorfismo de Longitud de Fragmentos Amplificados (AFLPs)

https://doi.org/10.17584/rcch.2017v11i2.7342

Publicado 2018-01-06

  • Liliana Yanet Suárez-Contreras

Liliana Yanet Suárez-Contreras
Facultad de Ciencias Agrarias, Departamento de Ciencias del Medio Ambiente, Grupo de Investigación Ambiente y Vida (GIAV), Universidad Francisco de Paula Santander, Cúcuta

Moniliophthora roreri. Foto: L. Quintero

Resumen

El cultivo de cacao, está afectado por el fitopatógeno Moniliophthora roreri, que causa gran pérdida en la producción en Norte de Santander. Este estudio muestra los resultados obtenidos utilizando AFLPs de M. roreri. Con el kit para sistema de análisis II, estandarizado y aplicado a 56 muestras de M. roreri, aisladas de nueve municipios. La combinación que presentó mayor número de polimorfismos fue E-ACC/ M-CAA, con 100 bandas y un número menor de alelos (6), con la combinación E-ACG/ M-CAA se obtuvieron 90 bandas y un número de alelos mayor (23), y con la combinación E-AAC/ M-CAA se presentaron 94 bandas y alelos (12). El análisis de datos se realizó según el dendrograma de similitud o distancias genéticas de Nei, obteniéndose cinco grupos con una alta variabilidad entre las muestras, del 6,5 al 58%. Al combinar la información morfológica y molecular se determinó el nivel de diversidad genética de Moniliophthora roreri.

Palabras clave

Marcador molecular, similaridad genética, moniliasis, fitopatógeno, caracterización molecular.

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Citas

  1. Barcelos, E. 2002. Genetic diversity and relationship in American and African oil palm as revealed by RFLP and AFLP molecular Markers. Pesq. Agropec. Bras. 37(8), 1105-1114. Doi: https://doi.org/10.1590/S0100-204X2002000800008
  2. Billotte, N., L. Frances, P. Amblard, T. Durandgasselin, J.L. Noyer y B. Courtois. 2001. Search for AFLP and microsatellite molecular markers of the SH gene in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) by bulk segregan analysis (BSA) and by genetic mapping. pp. 442-445. En: PIPOC International Palm Oil Congress-Cutting-edge technologies for sustained competitiveness, Proceedings Agriculture. Malasia.
  3. Chua, K.L., R. Singh y S.C. Cheah. 2001. Construction of oild palm (Elaeis guineensis Jacq.). Linkage maps using AFLP markers. pp. 461-467. En: PIPOC International Palm Oil Congress-Cutting-edge technologies for sustained competitiveness, Proceedings Agriculture. Malasia.
  4. Correa, J., S. Castro y J. Coy. 2014. Estado de la moniliasis del cacao causada por Moniliophthora roreri en Colombia. Acta Agron. 63(4), 388-399. Doi: https://doi.org/10.15446/acag.v63n4.42747
  5. Díaz-Valderrama, J.R. y M.C. Aime. 2016. The cacao pathogen Moniliophthora roreri (Marasmiaceae) possesses biallelic A and B mating loci but reproduces clonally. Heredity 116, 491-501. Doi: https://doi.org/10.1038/hdy.2016.5
  7. Galeano, C.H. 2005. Estandarización de la técnica molecular de AFLP en palma de aceite tipo Dura (Elaeis guineensis Jacq.) y estudio preliminar de caracterización. Agron. Colomb. 23(1), 42-49.
  8. González, G., S. Aleman y D. Infante. 2003. Asexual genetic variability in Agave fourcroydes II: selection among individuals in a clonally propagated population. Plant Sci. 165(3), 595-601. Doi: https://doi.org/10.1016/S0168-9452(03)00227-9
  9. Grisales, S. y L. Afanador. 2007. Análisis de variabilidad genética en Moniliophthora roreri con AP-PCR y RAPD en Antioquia, Colombia. Rev. Colomb. Biotecnol. 9(2), 15-32.
  10. Hong, Y. y A. Chuah. 2003. A format for databasing and comparison of AFLP fingerprintint profiles. BMC Bioinformatics 4(7), 1-11.
  11. Innan, H., R. Terauchi, G. Kahl y F. Tajima. 1999. A method for estimating nucleotide diversity from AFLP data. Genet. 151, 1157-1164.
  12. Karp, A. y K. Edwards. 1997. DNA markers: a global overview. pp. 1-13. En: Caetano-Anollés, G. y P.M. Gresshoff (eds.). DNA markers: protocols, aplications and overviews. Wiley, New York, USA.
  13. Majer, D., R. Mithen, B.G. Lewis, P. Vos y R.P. Oliver. 1996. The use of AFLP fingerprinting for the detection of genetic variation in fungi. Mycol Res. (110), 1107-1111. Doi: https://doi.org/10.1016/S0953-7562(96)80222-X
  14. Márquez, M. 2003. Caracterización molecular y morfológica de progenies de árboles plus seleccionadas dentro del ensayo de procedencias y progenies de Cordia alliodora de cenicafé-Colombia. Tesis de maestría. Centro Agronómico Tropical de Investigación y Enseñanza (CATIE). Turrialba, Costa Rica.
  15. Mayes, S., P.L. Jack, D.F. Marshall y R.H.V. Corley. 1997. Construction of RFLP genetic link-age map for oil palm. (Elaeis guineensis Jacq.). Genome 40(1), 116-122. Doi: 10.1139/g97-016
  16. Mueller, U.G., S.E. Lipari y M.G. Milgroom. 1996. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) fingerprinting of symbiotic fungi cultured by the fungus-growing ant Cyphomyrmes minutus. Mol. Ecol. (5), 119-122. Doi: https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.1996.tb00297.x
  17. Mueller, U.G. y L.L. Wolfenbarger. 1999. AFLP genotyping and fingerprinting. Tree. (14), 389-394. Doi: https://doi.org/10.1016/S0169-5347(99)01659-6
  18. Nei, M. y W.H. Li. 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonuclease. Proc. Nat. Acad. Sci. 76(10), 5269-5273. Doi: https://doi.org/10.1073/pnas.76.10.5269
  19. Osorio, M., E. Gámez, S. Molina y D. Infante. 2012. Evaluation of cassava plants generated by somatic embryogenesis in different stages of development using molecular markers. Electron. J. Biotechnol. 15(4), Doi: https://doi.org/10.2225/vol15-issue4-fulltext-3
  20. Paredes, M. 2016. El manejo fitosanitario del cultivo de cacao nacional (Theobroma cacao L.) y el rendimiento del mismo, en la asociación kallari. Tesis de maestría. Universidad Técnica de Ambato, Ambato, Ecuador.
  21. Powell, W., M. Morganten, C. Andre, M. Hanafey, J. Voguel, S. Tingey y A. Rafaskyl. 1996. The Comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR markers for germplasm analysis. Mol. Breed. 2(3), 225-238. Doi: https://doi.org/10.1007/BF00564200
  22. Phillips-Mora, W. 2013. Un hongo mortal. En: CropLife Latinamerica, https://www.croplifela.org/es/plagas/listado-de-plagas/220-moniliasis-del-cacao; consulta: agosto de 2017.
  23. Phillips-Mora, W. 2003. Origin, biogeography, genetic diversity and taxonomic affinities of the cacao (Theobroma cacao L.) fungus Moniliophthora roreri (Cif.) Evans et al. as determined using molecular, phytopathological and morpho-physiolofical evidence. Ph.D. thesis. Department of Agricultural Botany, University of Reading, Reading, UK.
  24. Purba, A.R., J.L. Noyer, L. Baudouin, X. Perrier, S. Hamon y P.J.L. Lagoda. 2000. A new aspect of genetic diversity of Indonesian oil alm (Elaeis guineensis Jacq.) revealed by isoenzime and AFLP markers and its consequences for breeding. Theor. Appl. Genet. (101), 956-961. Doi: https://doi.org/10.1007/s001220051567
  25. Rey, L., P. Gómez, I. Ayala, W. Delgado y P. Rocha. 2004. Colecciones genéticas de palma de aceite Elaeis guineensis (Jacq.) y Elaeis oleifera (H.B.K.) de Cenipalma: Características de importancia para el sector palmicultor. Palmas 25(2), 39-48.
  26. Rocha, P. 2003. Marcadores moleculares, una herramienta útil para la selección genética de palma de aceite. Palmas 24(2), 11-25.
  27. Shah, F., O. Rashid, A.J. Simons y A. Dundson. 1994. The utility of RAPD markers for determination of genetic variation in oil palm (Elaeis guineensis). Theor. Appl. Genet. (89), 713-718. Doi: https://doi.org/10.1007/BF00223710
  28. Shahin S., A.J. Shao, M.D. Strem, W. Phillips-Mora, D. Zhang, L.W. Meinhardt y B.A. Bailey. Combination of RNA seq and SNP nano fluidi carray reveals the center of genetic diversity of cacao pathogen Moniliophthora roreri in the upper Magdalena Valley of Colombia and its clonality. 2015. Frontiers Microbiol. Doi: https://doi.org/10.3389/fmicb.2015.00850
  29. Suárez, L. 2005. Extracción y purificación del ADN de Moniliophthora roreri hongo que ataca el cacao, en Norte de Santander. Respuestas 10(2). Doi: https://doi.org/10.22463/0122820X.629
  30. Suárez, L. 2006. Aislamiento e identificación de Moniliophthora roreri causante de la moniliasis en municipios del nororiente Colombiano. Respuestas 11(1). Doi: https://doi.org/10.22463/0122820X.623
  31. Suárez, L. 2016. Identificación molecular de aislamientos de Moniliophthora roreri en huertos de cacao de Norte de Santander, Colombia. Acta Agron. 65(1), 51-57. Doi: https://doi.org/10.15446/acag.v65n1.47994
  32. Suárez, L. y A. Rangel. 2013. Aislamiento de microorganismos para control biológico de Moniliophthora roreri. Acta Agron. 62(4), 370-378.
  33. Tirado-Gallego, P.A., A. Lopera-Alvarez y L.A. Rios-Osorio. 2016. Estrategias de control de Moniliophthora roreri y Moniliophthora perniciosa en Theobroma cacao L.: revisión sistemática. Corpoica. Cienc. Tecnol. Agropec. 17(3), 417-430. Doi: https://doi.org/10.21930/rcta.vol17_num3_art:517
  34. Tredway, L.P., J.F. White, B.S. Gaut, P.V. Reddy, M.D. Richardson y B.B. Clark. 1999. Philogenetic relationships within and between Epichloe and Neotyphodium endophytes as estimated by AFLP markers and rDNA sequences. Mycological Res. 103(12), 1593-1603. Doi: https://doi.org/10.1017/S0953756299008874
  35. Tuquerres, H.L. 2016. Evaluación de cepas de Trichoderma spp. en el control de monilla (Moniliophthora roreri), en cacao (Theobroma cacao) in vitro y en campo en la provincia de Napo-Ecuador. Trabajo de grado. Universidad de las Fuerzas Armada - ESPE, Sangolquí, Ecuador.
  36. Villamizar, R., J. Osma y O. Ortíz. 2016. Fungicidal effect of silver nanoparticles on toxigenic fungi in cocoa. Pesq. Agropec. Bras. 51(12), 1929-1936. Doi: https://doi.org/10.1590/s0100-204x2016001200003
  37. Vos, P., R. Hogers, M. Bleeker, M. Reijans, T. Van de Lee, M. Hornes, A. Frijters, J. Pot, J. Peleman, M. Kuiper y M. Zabeau. 1995. AFLP: A New technique for DNA fingerprinting. Nucleic Acids Res. 23(21), 4407-4414. Doi: https://doi.org/10.1093/nar/23.21.4407

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