Classification with linear discriminant analysis of morphological variables in peach (<i>Prunus persica</i> L. Batsch) ‘Jarillo’ in the Santandereana Mountains, Colombia
Abstract
During 2014, in the province of Pamplona, Colombia, a study on the peach variety Jarillo was carried out in order to classify a series of morphometric variables in this crop, grown at three different altitudes (Pamplona, 2,170 m a.s.l., Chitaga, 1,870 m a.s.l., and Pamplonita, 1,670 m a.s.l). The conditional Latin hypercube sampling approach was used to select samples of the trees. In the leaves, the width was measured with the length of the limbs and the limbus area using the software ImageJ. In the fruits, the longitudinal r on the equatorial diameter and dry weight were measured. The linear discriminant analysis technique was applied, which was complemented with boxes diagram by farm with the values of the discriminant function for the samples of the different groups and ended with the scatter plot of the two best discriminant functions. This classification suggested different agronomic management plans for Pamplonita and Chitagá, especially for the harvest that involved the dry weight of the fruits. There is a common area between Pamplona and Pamplonita, which can be attributed to the fact that both are in the Catatumbo basin. The values of length and width of the limbus and limbus area were highly discriminating characteristics in this study and were susceptible to change because of environmental factors. The study concluded that the farms Chitagá and Pamplonita were clearly discriminated according to the measured variables, reaching discriminant function with 89.3% separation in the variables.
Keywords
morfometría, muestreo hipercubo latino condicional, clasificación estadística
References
- Arcila, P. y C.B. Chaves. 1995. Desarrollo foliar del cafeto en tres densidades de siembra. Cenicafé 46(1), 5-20.
- Aribal, L.G., J.G. Bonggay y E.S. Fernando. 2017. Leaf size indices and structure of the peat swamp forest. Global J. Environ. Sci. Manag. 3(1), 63-74. Doi: 10.22034/gjesm.2017.03.01.007
- Avilán, L., E. Soto, M. Pérez, C. Marín, M. Rodríguez y J. Ruiz. 2009. Comportamiento fenológico de la raza antillana de aguacate en la región centro-norte costera de Venezuela. Agron. Trop. 59(1), 5-14.
- Beckman, R. y R. Cook. 1983. Outlier … s (with discussion). Technometries 25(29), 119-149.
- Blanco, J.A., O. Balocchi e I. López. 2010. Variabilidad fenotípica en accesiones de Bromus valdivianus Phil. Agro Sur 38(2), 68-79. Doi: 10.4206/agrosur.2010.v38n2-02
- Campos, T. de J. 2013. Especies y variedades de hoja caduca en Colombia. pp. 47-64. En: Miranda, D., G. Fischer y C. Carranza (eds.). Los frutales caducifolios en Colombia - Situación actual, sistemas de cultivo y plan de desarrollo. Sociedad Colombiana de Ciencias Hortícolas, Bogotá.
- Cárdenas, J. y G. Fischer. 2013. Clasificación botánica y morfología de manzano, peral, duraznero y ciruelo. pp. 21-30. En: Miranda, D., G. Fischer y C. Carranza (eds.). Los frutales caducifolios en Colombia - Situación actual, sistemas de cultivo y plan de desarrollo . Sociedad Colombiana de Ciencias Hortícolas, Bogotá.
- Carranza, C. y D. Miranda. 2013. Zonificación actual de los sistemas de producción de frutales caducifolios en Colombia. pp. 67-86. En: Miranda, D. , G. Fischer y C. Carranza (eds.). Los frutales caducifolios en Colombia - Situación actual, sistemas de cultivo y plan de desarrollo. Sociedad Colombiana de Ciencias Hortícolas, Bogotá.
- Casierra-Posada, F,. V.E. Barreto y O.L. Fonseca. 2004. Crecimiento de frutos y ramas de duraznero (P. persica L. Batsch, cv. ‘Conservero’) en los altiplanos colombianos. Agron. Colomb. 22(1), 40-45.
- Delgado, I., H. Jorge, H. García, N. Bernal, F.R. Díaz, I. Jorge, A. Bernal, O. Rivera, P. Machado, F. Barroso, M. Buedo, S. Reyes, A. Gallardo, J. Barroso, J. Rosa, L.F. Machado, J.L. Pérez y J.R. Fardales. 2008. Utilización de los análisis multivariados en la clasificación de ambientes en caña de azúcar. Centro Agríc. 35(4), 53-57.
- Fernández, G. 2013. Caracterización de los productores de durazno (P. persica L. Batsch) del municipio de Cácota, Norte de Santander. Trabajo de grado. Universidad de Pamplona, Pamplona, Colombia.
- Fischer, G. 2013. Comportamiento de los frutales caducifolios en el trópico. pp. 31-46. En: Miranda, D. , G. Fischer y C. Carranza (eds.). Los frutales caducifolios en Colombia - Situación actual, sistemas de cultivo y plan de desarrollo. Sociedad Colombiana de Ciencias Hortícolas, Bogotá.
- Fischer, G. 1995. Effect of root-zone temperatura and tropical altitude on the growth, development and fruit quality of cape gooseberry (Physalis peruviana L.). Tesis de doctorado. Humboldt-Universität zu Berlin, Berlín, Alemania.
- Fischer, G., F. Casierra-Posada y C. Villamizar. 2010. Producción forzada de duraznero (P. persica (L.) Batsch) en el altiplano tropical de Boyacá (Colombia). Rev. Colomb. Cienc. Hortíc. 4(1), 19-32. Doi: 10.17584/rcch.2010v4i1.1223
- Fischer, G. , F. Ramírez y F. Casierra-Posada. 2016. Ecophysiological aspects of fruit crops in the era of climate change. A review. Agron. Colomb. 34(2), 190-199. Doi: 10.15446/agron.colomb.v34n2.56799
- Garrido, E.M., T.G. Rujano, A. Torres, E. Sangronis, J.A. Martínez, L.C. Chaparro y L. Sánchez. 2013. Análisis de las características físicas y químicas del fruto de mango (Mangifera indica L.) ‘Bocado’ de tres localidades del Estado Cojedes, Venezuela. Rev. Venez. Cienc. Tecnol. Aliment 4(2), 189-206.
- Gómez, D., O. Solano, V. Osorio, L. Huamán, G. Ramón, J.I. Condado, M. Gallardo y Y.M. Quinteros. 2013. Identificación de observaciones influyentes en la discriminación de muestras del género Minthostachys de Cajatambo y Unchos. Pesquimat 15(2), 15-28.
- Gordon-Colón, E., L.M. Suárez-Villasmil, L. Polanco y E.M. Barreto-Pittol. 2013. Distribución geográfica y variación foliar de Montrichardia arborescens en Venezuela. Acta Biol. Venez. 33(1-2), 23-42.
- Henderson, A. 2006. Traditional morphometrics in plant systematics and its role in palm systematics. Bot. J. Linn. Soc. 151(1), 103-111. Doi: 10.1111/j.1095-8339.2006.00526.x
- Jobson, J.D. 1992. Applied multivariate data analysis. Vol. II: Categorical and multivariate methods. Springer Science and Business Media, New York, NY. Doi: 10.1007/978-1-4612-0921-8
- MADR. 2012. Anuario estadístico de fruta y hortalizas 2007-2011 y sus calendarios de siembras y cosechas. Resultados evaluaciones agropecuarias municipales 2011. Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural de Colombia, Bogotá.
- Manly, B.F.J. y A.J.A. Navarro. 2017. Multivariate statistical methods. A primer. 3rd ed. Chapman & Hall, CRC Press, Boca Raton, FL.
- Meier U. 1997. BBCH-Monograph. Growth stages of plants. Blackwell Wissenschaftsverlag, Berlin, Alemania.
- Meier U., H. Bleiholder, L. Buhr, C. Feller, H. Hack, M. Heß, P.D. Lancashire, U. Schnock, R. Stauß, T. van den Boom, E. Weber y P. Zwerger. 2009. The BBCH system to coding the phenological growth stages of plants-history and publications. J. Cultiv. Plants 61, 41-52.
- Minasny, B., B.P. Malone y A.B. McBratney. 2012. digital soil assessment and beyond. CRC Press, Taylor & Francis Group, London, UK.
- Oppong, F.B. and S.Y. Agbedra. 2016. Assessing univariate and multivariate normality. a guide for non-statisticians. Math. Theory Modeling 6(2), 26-33.
- Pintaluba, N. and P.A. Luaces. 2013. Caracterización de frutas comestibles de especies nativas de uso popular en el parque provincial “Salto encantado del valle del Cuñá- Pirú - misiones”. Bonplandia 22(2), 191-201.
- Pinzón, E.H., A.C. Morillo yG. Fischer . 2014. Aspectos fisiológicos del duraznero (P. persica [L.] Batsch.) en el trópico alto. Una revisión. Rev. UDCA Act. Div. Cient. 17(2), 401-411.
- Rasband, W. S. 2010. ImageJ. U.S. National Institute of Health, Bethesda, MD, USA.
- Sanabria, A. 2011. Crecimiento vegetativo, reproductivo y fenología. pp. 21-27. En: Aular, J., M. Casares y J. Gebaüer (eds.). Manejo hortícola de huertos de duraznero. Universidad Centro Occidental “Lisandro Alvarado”, Barquisimeto, Venezuela.
- William, B.K. 1983. Some observations of the use of discriminant analysis in ecology. Ecol. 64(5), 1283-1291. Doi: 10.2307/1937836